Bakterien sind Mikroorganismen bzw. Kleinstlebewesen. Im Mund jedes Menschen leben über 500 verschiedene Bakterienarten. Sie siedeln sich an Zahnoberflächen, besonders an rauen Stellen, in Zahnstein und in den Zahnzwischenräumen an. Viele Bakterien im Mund produzieren im Laufe der Zeit Beläge auf den Zahnoberflächen.

Verantwortlich für die Entstehung von Karies sind vor allem die Bakterienarten Streptoccocus mutans und Lactobazillus acidophilus. Diese Mikroorganismen produzieren aus Lebensmittelresten, vor allem aus Kohlenhydraten wie Zucker, zahnschädigende Säure.